Biopython - 測試技術



Biopython 擁有廣泛的測試指令碼,用於在不同條件下測試軟體,以確保軟體沒有錯誤。要執行測試指令碼,請下載 Biopython 的原始碼,然後執行以下命令 −

python run_tests.py

這將執行所有測試指令碼並給出以下輸出 −

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

我們還可以按如下所示執行單個測試指令碼 −

python test_AlignIO.py

結論

正如我們所瞭解的,Biopython 是生物資訊學領域的其中一個重要軟體。由於以 python 編寫(易於學習和編寫),它提供了廣泛的功能,可用於處理生物資訊學領域的任何計算和操作。它還為幾乎所有流行的生物資訊學軟體提供了簡單且靈活的介面,以利用其功能。

廣告
© . All rights reserved.