Biopython - 安裝

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本節介紹如何在您的機器上安裝 Biopython。安裝非常簡單，只需不到五分鐘。

步驟 1 - 驗證 Python 安裝

Biopython 旨在與 Python 2.5 或更高版本一起使用。因此，必須首先安裝 python。在命令提示符中執行以下命令：

> python --version

定義如下：

如果正確安裝，它將顯示 python 的版本。否則，下載最新版本的 python，安裝它，然後再次執行該命令。

步驟 2 - 使用 pip 安裝 Biopython

在所有平臺上，使用命令列中的 pip 安裝 Biopython 非常簡單。輸入以下命令：

> pip install biopython

您將在螢幕上看到以下響應：

更新舊版本的 Biopython：

> pip install biopython –-upgrade

您將在螢幕上看到以下響應：

執行此命令後，將在安裝最新版本之前刪除舊版本的 Biopython 和 NumPy（Biopython 依賴於它）。

步驟 3 - 驗證 Biopython 安裝

現在，您已成功在您的機器上安裝了 Biopython。要驗證 Biopython 是否已正確安裝，請在您的 python 控制檯中輸入以下命令：

它顯示 Biopython 的版本。

替代方法 - 使用原始碼安裝 Biopython

要使用原始碼安裝 Biopython，請按照以下說明操作：

從以下連結下載 Biopython 的最新版本：https://biopython.org/wiki/Download

截至目前，最新版本為biopython-1.72。

下載檔案並解壓縮壓縮的檔案檔案，移動到原始碼資料夾並輸入以下命令：

> python setup.py build

這將根據以下說明從原始碼構建 Biopython：

現在，使用以下命令測試程式碼：

> python setup.py test

最後，使用以下命令安裝：

> python setup.py install