鳥槍法測序和下一代測序的區別

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關鍵詞

DNA 序列，小片段，基因測序，毛細管電泳，核苷酸，基因組。

引言

鳥槍法測序和下一代測序的主要區別在於：鳥槍法測序是一種將DNA序列隨機分解成許多小片段，然後透過觀察重疊區域重新組裝序列的測序方法。而下一代測序 (NGS) 是一種先進的基因測序方法，它依賴於毛細管電泳。

測序是確定基因、基因簇、染色體和完整基因組中核苷酸精確順序的過程。它在基因組學研究、法醫學、病毒學、生物系統學、醫學診斷、生物技術和許多其他領域中非常重要，用於分析基因的結構和功能以及鑑定生物體。此外，還有不同型別的測序方法可用。鳥槍法測序和下一代測序是其中兩種先進的方法。

什麼是鳥槍法測序？

鳥槍法測序是一種測序方法，它將整個染色體或整個基因組的DNA序列隨機分解成許多小片段，然後透過計算機觀察重疊序列或區域來重新組裝序列。通常，哺乳動物基因組在結構上覆雜且體積較大。

因此，由於耗時，克隆測序它們很困難。鳥槍法測序是一種更快的方法。它也更便宜。因此，現代科學家依靠鳥槍法測序方法來處理複雜的基因組。

鳥槍法測序程式相對簡單。它從將整個基因組片段化為 20-300 千鹼基對的不同大小開始。然後，應使用鏈終止法對每個片段進行測序。

測序後，有必要使用複雜的計算機軟體檢視重疊區域來組裝片段。此方法不需要傳統的序列作圖和克隆。此外，此方法不使用遺傳圖譜。由於沒有使用現有的基因組圖譜，因此組裝過程中更容易出錯。

這是這種方法的主要缺點之一。因此，較短的片段為此方法中的每次讀取提供的資訊較少。鳥槍法測序無法產生足夠的資料來確定所需精度標準的共有序列。

除了上述缺點外，鳥槍法測序方法目前是測序包括細菌、病毒和酵母菌在內的微生物基因組最有效和最經濟的策略。這是因為它們的基因組缺乏難以測序的重複區域，並且可以輕鬆地將這些基因組組裝成染色體而不會出錯。

什麼是下一代測序？

下一代測序 (NGS) 這一術語指的是現代高通量測序過程。它描述了幾種不同的現代測序技術，這些技術徹底改變了基因組學研究和分子生物學。

NGS 系統更快、更便宜。NGS 系統中使用了四種主要的 DNA 測序方法：焦磷酸測序、合成測序、連線測序和離子半導體測序。NGS 可以並行測序許多 DNA 或 RNA 鏈（數百萬）。它允許在短時間內測序生物體的整個基因組。

NGS 具有不同的優勢。它是一個高速、更準確且經濟高效的過程，可以使用少量樣品進行。因此，它能夠在單個測序實驗中分析整個人類基因組。

NGS 可用於宏基因組學研究、檢測由於插入和缺失等導致的個體基因組內的變異以及分析基因表達。NGS 可以同時分析來自大量組織的完整轉錄組。因此，NGS 徹底改變了轉錄組的分析。

鳥槍法測序和下一代測序的相似之處

• 鳥槍法測序和下一代測序是兩種基因組測序方法。
• 兩種方法都是快速的方法。
• 此外，它們都是經濟有效的方法。
• 它們可以並行測序許多 DNA 片段。

鳥槍法測序和下一代測序的區別

鳥槍法測序和下一代測序是兩種先進的測序技術。鳥槍法測序方法將整個染色體或整個基因組的 DNA 序列隨機分解成許多小片段，然後透過計算機觀察重疊序列或區域來重新組裝序列。

相反，下一代測序 (NGS) 這一術語指的是現代高通量測序過程。因此，這是鳥槍法測序和下一代測序之間的主要區別。

下一代測序是一種依賴於毛細管電泳的技術，而鳥槍法測序則不依賴。因此，這也是鳥槍法測序和下一代測序之間的區別。此外，與鳥槍法測序相比，下一代測序具有更高的靈敏度和更高的準確性。

NGS 的優勢

一些優勢包括：

• 更高的靈敏度，可以檢測低頻變異。
• 高樣本量的週轉時間更快。
• 全面的基因組覆蓋率。
• 較低的檢測限。
• 使用樣品多路複用提高容量。
• 能夠同時測序數百到數千個基因或基因區域。

結論

鳥槍法測序和下一代測序是基因組測序中使用的兩種測序方法。這兩種方法都是快速且經濟有效的方法。NGS 的原理是透過測序系統以快速的方式同時測序數百萬個序列。相反，鳥槍法測序需要將基因組分解成小片段，然後使用重疊序列進行測序和重新組裝。因此，這就是鳥槍法測序和下一代測序之間區別的總結。