什麼是Z-DNA以及哪些序列可以形成它?
介紹
脫氧核糖核酸 (DNA) 是一種長聚合物,由四種類型的核苷酸組成:腺嘌呤 (A)、胞嘧啶 (C)、鳥嘌呤 (G) 和胸腺嘧啶 (T)。這些核苷酸形成鹼基對,A 與 T 配對,C 與 G 配對。
DNA分子通常是雙鏈的,兩條鏈方向相反,鹼基對堆疊在中心。這種結構被稱為B型DNA,是細胞中最常見的DNA形式。

Z-DNA:結構和序列
另一種稱為Z-DNA的DNA形式在結構和序列上都與B-DNA不同。
Z-DNA具有左旋螺旋結構,這意味著它的扭曲方向與B-DNA相反。Z-DNA的結構呈鋸齒狀,鹼基對向骨架傾斜。螺旋的直徑為18埃,每圈螺旋有12個鹼基對。
Z-DNA的大溝狹窄而深,小溝寬而淺,這與B-DNA相反。
Z-DNA的序列也與B-DNA不同。當DNA序列具有高密度的嘌呤-嘧啶交替鹼基時,就會形成Z-DNA,例如:
CGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCG。
這些序列具有高度傾向於採用左旋螺旋結構,因為交替模式允許骨架採用更有利於Z-DNA螺旋形成的延伸構象。
Z-DNA也可以由具有高密度CpG二核苷酸的序列形成,例如:
GCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGC
因為CpG二核苷酸中胞嘧啶的甲基化可以穩定Z-DNA結構。
Z-DNA的形成
Z-DNA的形成可以由不同的因素觸發,例如離子條件、溫度和超螺旋的變化。Z-DNA在高鹽濃度下更穩定,因為鹽中的陽離子可以中和DNA骨架的負電荷並穩定左旋螺旋構象。溫度變化也會影響Z-DNA的形成,因為螺旋結構在較低溫度下更穩定。超螺旋(DNA雙螺旋的扭曲)也可以誘導Z-DNA的形成,因為DNA拓撲結構的變化可以使螺旋變形,並有利於採用左旋螺旋結構。
Z-DNA的功能
Z-DNA的生物學功能尚未完全瞭解,但有人認為它在轉錄、複製和DNA修復中發揮作用。Z-DNA經常出現在活躍轉錄位點,有人提出它在基因表達調控中發揮作用。Z-DNA可以誘導DNA分子的構象變化,從而影響轉錄因子的結合和RNA聚合酶的結合,這可以調節基因的轉錄活性。
Z-DNA也與DNA複製和修復有關。在DNA複製過程中,DNA分子被解旋酶解開,兩條鏈分離。Z-DNA可以在複製過程中形成,有人認為Z-DNA的形成會減慢或阻止複製機制,導致複製錯誤和DNA損傷。Z-DNA也被認為在受損DNA的識別中發揮作用。
常見問題
Q1. Z-DNA和B-DNA有什麼區別?
A1. Z-DNA在結構和序列上都與B-DNA不同。
Z-DNA具有左旋螺旋結構,Z-DNA的結構呈鋸齒狀,鹼基對向骨架傾斜。Z-DNA的序列是在DNA序列具有高密度的嘌呤-嘧啶交替鹼基時形成的。
B-DNA具有右旋螺旋結構。B-DNA具有更規則的結構,鹼基對堆疊在螺旋的中心,序列可以是A、C、G和T的任何組合。
Q2. Z-DNA是如何形成的?
A2. Z-DNA可以由不同的因素形成,例如離子條件、溫度和超螺旋的變化。Z-DNA在高鹽濃度下更穩定,溫度變化也會影響Z-DNA的形成,因為螺旋結構在較低溫度下更穩定。超螺旋可以誘導Z-DNA的形成,因為DNA拓撲結構的變化可以使螺旋變形,並有利於採用左旋螺旋結構。
Q3. Z-DNA的生物學功能是什麼?
A3. Z-DNA的生物學功能,它經常出現在活躍轉錄位點,有人提出它在基因表達調控中發揮作用。
Z-DNA可以誘導DNA分子的構象變化,從而影響轉錄因子的結合和RNA聚合酶的結合,這可以調節基因的轉錄活性。
Z-DNA也與DNA複製和修復有關,有人認為Z-DNA的形成會減慢或阻止複製機制,導致複製錯誤和DNA損傷。
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