R 中 pheatmap 函式有什麼用途?


pheatmap 函式用於建立聚類熱圖,但我們可以透過使用 color 引數改變繪圖的美感,而 color 引數是 pheatmap 函式的主要功能之一。還有很多其他引數將 pheatmap 函式與 heatmap 函式區別開來。

示例

library(pheatmap)
M1<-matrix(rpois(25,5),ncol=5)
M1

輸出

   [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] 3    4    6    4    7
[2,] 8    4    4    4    4
[3,] 3    4    4    3    5
[4,] 6    6    5    2    5
[5,] 6    2    4    9    5

示例

pheatmap(M1,color=1:25)

輸出

示例

 現場演示

M2<-matrix(rnorm(49,5,1.1),ncol=7)
M2

輸出

      [,1]       [,2]    [,3]       [,4]    [,5]    [,6]    [,7]
[1,] 4.778689 3.170058 3.236074 4.924220 6.344139 5.165052 4.430805
[2,] 6.251534 3.627046 5.744434 4.981911 4.974563 5.472041 4.414312
[3,] 4.559849 4.104897 4.471648 5.627426 4.560692 4.637538 4.764127
[4,] 3.696921 3.644598 4.884887 6.319531 6.758847 5.693916 5.416243
[5,] 4.047975 5.451307 5.103429 5.589361 5.633622 2.823698 5.769911
[6,] 4.203473 3.700089 3.900442 5.271490 5.186845 4.887599 6.051715
[7,] 5.328909 5.717243 4.478628 6.739882 4.761643 4.895137 3.506979

示例

pheatmap(M2,color=1:7)

輸出

更新於: 2020 年 12 月 7 日

87 次瀏覽

開啟 職業生涯

透過完成課程獲得認證

開始
廣告
© . All rights reserved.