DNA損傷與修復機制
簡介
DNA是遺傳物質,它為所有生物體的發育、功能和繁殖提供指令。它是生命的分子基礎,任何對其的損傷都可能對生物體造成嚴重後果。DNA損傷可以自發發生,也可以由接觸輻射、化學物質和病毒等環境因素引起。
這種損傷可能導致突變,最終導致癌症、衰老和神經退行性疾病等疾病。
為了維持遺傳物質的完整性,細胞已經發展出幾種修復DNA損傷的機制。這些機制對於生物體的生存和健康至關重要。

什麼是DNA損傷?
DNA損傷是指任何可能干擾其正常功能的DNA化學結構變化。它可以發生在核苷酸鹼基、糖磷酸骨架或雙鏈螺旋的水平。
一些最常見的DNA損傷型別包括
單鏈斷裂:當DNA分子的兩條鏈中的一條斷裂時發生這種情況。
雙鏈斷裂:當DNA分子的兩條鏈都斷裂時發生這種情況。
鹼基損傷:這種損傷發生在DNA分子中的一個核苷酸鹼基被改變或修飾時。
交聯:當DNA的兩條或多條鏈共價連線在一起時發生這種情況。

什麼導致DNA損傷?
DNA損傷可以自發地由於DNA複製過程中發生的錯誤而發生,也可以由於接觸輻射、化學物質和病毒等環境因素而發生。
最常見的DNA損傷來源包括
紫外線(UV)輻射:這會導致胸腺嘧啶二聚體,這是DNA分子中兩個相鄰胸腺嘧啶鹼基之間的共價鍵。
電離輻射:這會導致DNA分子中雙鏈斷裂。
化學物質:許多化學物質,如苯和香菸煙霧,會導致DNA損傷。
病毒:一些病毒,如人乳頭瘤病毒(HPV),會導致DNA損傷。
如果DNA沒有修復會發生什麼?
如果DNA損傷沒有修復,它可能導致突變,最終導致癌症、衰老和神經退行性疾病等疾病。當受損的DNA被複制並且錯誤沒有被糾正時,就會發生突變。
突變可能導致蛋白質氨基酸序列的變化,這會影響其功能。例如,BRCA1基因的突變會增加患乳腺癌和卵巢癌的風險。

DNA修復機制是如何工作的?
DNA修復機制對於維持基因組完整性至關重要。它們可以分為兩類:直接修復和間接修復。
直接修復
直接修復機制包括在不移除任何核苷酸的情況下逆轉DNA損傷。有三種類型的直接修復機制:
光復活:這種機制修復由紫外線輻射引起的胸腺嘧啶二聚體。它涉及使用光解酶,這種酶利用光能來打破胸腺嘧啶鹼基之間的共價鍵。
烷基轉移酶:這種機制修復DNA鹼基的烷基化損傷。它涉及使用烷基轉移酶,這種酶將烷基從受損鹼基轉移到酶中的半胱氨酸殘基。
甲基鳥嘌呤甲基轉移酶(MGMT):這種機制修復由如亞硝基脲等化學物質引起的鳥嘌呤O6位點的損傷。它涉及使用MGMT酶,這種酶將甲基從受損鹼基轉移到酶中的半胱氨酸殘基。

間接修復
間接修復機制包括去除受損的核苷酸,然後插入一個新的核苷酸。有幾種型別的間接修復機制:
鹼基切除修復(BER):這種機制修復受損或修飾的鹼基。它涉及到透過DNA糖基化酶去除受損的鹼基,然後透過AP核酸內切酶切割糖磷酸骨架。然後透過DNA聚合酶用新的核苷酸填充缺口,並且透過連線酶封閉切口。
核苷酸切除修復(NER):這種機制修復大的損傷,例如由紫外線輻射引起的嘧啶二聚體。它包括由蛋白質複合物識別損傷,然後切除包含損傷的短DNA片段。然後透過DNA聚合酶用新的核苷酸填充缺口,並且透過連線酶封閉切口。
細胞中的修復機制型別
除了前面提到的直接和間接修復機制外,細胞還使用其他修復機制來修復DNA損傷。這些機制不如直接和間接修復機制常見,但它們對於維持遺傳物質的完整性仍然至關重要。
跨損傷合成(TLS)
這種機制被細胞用來在細胞週期的S期複製過去的DNA損傷。它涉及使用專門的聚合酶,即使它們與正常的Watson-Crick鹼基配對規則不匹配,它們也可以在受損位點對面插入核苷酸。
TLS可能導致突變的引入,但它比可能導致更嚴重損傷的停滯複製叉更好。
非同源末端連線(NHEJ)
這種機制用於修復DNA中的雙鏈斷裂。它包括連線DNA分子的兩個斷裂末端,並且在斷裂點處可能丟失一些核苷酸。NHEJ是一種易錯的機制,但它比另一種同源重組(HR)機制更快。
替代末端連線(alt-EJ)
這是一種不太為人所知的雙鏈斷裂修復機制,當DNA分子的兩個斷裂末端不能透過NHEJ連線時發生。Alt-EJ涉及使用斷裂點附近的微同源區域來重新連線DNA鏈,導致核苷酸的丟失或增加。
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