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Python生物資訊學

人物圖示 Jesse E. Agbe

4.5

Python生物資訊學

學習使用BioPython、Biotite等工具進行序列分析的完整指南

更新時間圖示 更新於 2024年10月

語言圖示 語言 - 英文

人物圖示 Jesse E. Agbe

英語 [CC]

類別圖示 開發,程式語言,Python

講座 - 39

資源 - 4

時長 - 11小時

終身訪問

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課程描述

你知道嗎?如果以普通文字字型打印出來,人類基因組序列將長達約5000公里,這相當於倫敦到蒙特利爾、洛杉磯到巴拿馬、阿克拉到開普敦以及東京到加爾各答之間的距離?

同樣的序列大約可以填滿3000本普通大小的書。理解和分析這個序列顯然是一項巨大的任務。但隨著強大的工具和資料庫的出現,我們可以對它的一些方面有一個簡單的瞭解。

在本入門課程中,我們將探討用於分析DNA、RNA和基因組序列的各種Python工具和庫。

因此,如果您有興趣分析大量的生物資料,或者對DNA序列、蛋白質合成以及疫苗是如何設計的感到好奇,那麼本課程將適合您。

無論您是學生還是研究人員,是資料科學家還是生物資訊學家、計算生物學家,本課程都將成為您使用Python進行生物資訊學研究的有益指南。我們將探索使用BioPython、Biotite、BioJulia等進行生物資訊學分析。

資料無處不在,生物資料存在於每一個活著的生物體中。讓我們分析它以獲得有用的見解。

注意:這是一個入門課程,其結構類似於參考材料,面向那些幾乎沒有生物資訊學經驗的人。

在本課程中,我們將學習

  • 如何使用BioPython、Biotite等進行序列分析。
  • 如何用程式碼進行序列比對。
  • 如何建立我們自己的自定義函式來分析DNA、RNA和蛋白質。
  • 如何使用Python進行一些生物資訊學分析。
  • 如何分析Covid-19、MERS等的DNA序列。

加入我們,一起探索Python在生物資料領域的應用!

目標

  • 使用Python進行DNA序列分析。
  • 使用BioPython進行蛋白質合成。
  • 能夠建立我們自己的自定義函式來分析DNA、RNA和蛋白質。
  • 探索NCBI等生物資訊學資料庫。

先決條件

  • Python程式語言的基礎知識。
  • 生物資訊學的基礎知識。
  • 學習新事物的決心。
Bioinformatics with Python

課程大綱

檢視課程詳細內容分解

第1節 - 生物資訊學導論
6 個講座
  • 播放圖示 緒論 05:02 05:02
  • 播放圖示 什麼是DNA、RNA和蛋白質 04:52 04:52
  • 播放圖示 什麼是生物資訊學? 05:29 05:29
  • 播放圖示 什麼是蛋白質合成? 06:18 06:18
  • 播放圖示 生物資訊學資料庫 03:11 03:11
  • 播放圖示 設定我們的工作區 09:36 09:36
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Julia語言生物資訊學
2節課
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講師 詳情

Jesse E.Agbe

Jesse E. Agbe

關於我

嗨,我是Jesse,一名開發人員和研究員,痴迷於透過構建簡單實用的工具以及教導他人如何做到這一點來最佳化現有技術。

我的目標是幫助人們最佳化和利用技術來解決某些型別的問題,並在生活、信仰和事業上取得進步。

資料改變了我的生活,我期待分享我們如何利用資料改變人類。

加入我,讓我們一起學習和構建。


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